คณะสาธารณสุขศาสตร์ถูกจัดตั้งเป็นหน่วยงานอิสระในกำกับของมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์ เมื่อวันที่ 1 กันยายน พ.ศ.2548
